почему бы не сделать возможность вывода xml_id также как id (товара или статьи) в списке выводимых элементов.
- тоже самое и для поиска - искать по xml_id
- возможность вывода в списке, карточке товара, или в детальном просмотре статьи
- в корзине и форме оформления заказа
- в экспорте дать возможность выдавать этот элемент в параметры yandex'а