Проблема оказалась куда серьезнее. Параметры php.ini upload_max_filesize и post_max_size попросту игнорировались, если они были больше жестко указанного в коде (переменная settings в самом верху скрипта) значения. Для решения проблемы обработки максимального размера файла необходимо заменить строки скрипта bitrix/js/main/core/core_uploader/uploader.js 75-76 на следующие:
А также необходимо исправить ошибку обработки в последовательной загрузки - нужно перенести строки 1198-1199 с вычислением параметров после условия на строки 1213-1214.
1.
2.
3.
Для решения проблемы обработки максимального размера файла необходимо заменить строки скрипта bitrix/js/main/core/core_uploader/uploader.js 75-76 на следующие: