Сейчас сделано так, что разработчик может участвовать только в одном партнёрском аккаунте. Чаще всего - это студия в которой он работает. Но в этом случае разработчик не имеет возможности одновременно иметь личный партнёрский аккаунт.
Для примера, если я работаю в студии, но в свободное от работы время сделаю модуль для маркетплейса, я смогу его опубликовать только от имени студии.
Держать отдельный аккаунт не выход, т.к. репутация, сертификаты, темы на форуме и т.д. будут только на одном аккаунте.

Выставляю счета на marketplace.1c-bitrix.ru и на partners.1c-bitrix.ru, получается 2 разных счета, сделайте единую корзину и оформление заказов для партнеров

А главное чего не хватает - это система взаиморасчётов с аффилиатами с правилами перевода средств по запросу из личного кабинета на подключенные системы оплаты!

Нужно чтобы калькуляция могла проходить автоматически в указанное время, без вмешательства администраторов сайта.

Нужно чтобы администратор сайта мог выбирать по какому событию зачислять продажу аффилиату. На данный момент это отгрузка товара, но нужно чтобы это могло происходить например при смене статуса заказа на "оплачен".