Предлагаю в разделе "Отчет по рабочему времени" добавить в форму таблицы (после столбца "Рабочие часы" ) столбцы "Часы отсутствий" и "Количество отсутствий", в которой бы отображалась суммарная продолжительность и количество периодов отсутствия сотрудника на рабочем месте. Продолжительность таких отсутствий должна быть настраиваемой величиной (более n минут - начинается учет отсутствия).
Учет таких отсутствий целесообразно начинать, скажем, с 10 минут отсутствия, после которых начинается подсчёт времени. Сейчас в Битрикс чате такие отсутствия маркируются оранжевым цветом и иконкой "часов"/"циферблата", однако систематизировать данные о - нередко длительных - отлучках с рабочего места невозможно.
Целесообразно учитывать и суммировать такие данные по дням, неделям и месяцам. Это даст руководителям рабочих групп и кадровых служб дополнительный инструмент анализа персональной вовлеченности сотрудников в рабочий процесс, а также аргументы для указания каждому сотруднику на слишком частые или слишком продолжительные отвлечения от работы.
Кроме этого, можно увидеть процент замечаний, если например, было нарушение и сотрудник завершал день раньше установленного времени или начинал его позже.