Имеем Битрикс24 в облаке. Настроили синхронизацию с магазином на Битрикс.(Малый бизнес).
Сделки выгрузились в CRM, чтобы изменить статус заказа на сайте нужно зайти в блок товары, там нажать кнопку изменить и можно будет изменить статус заказа сайта. При этом стадия сделки статус не изменит.
То есть стадии сделки CRM и статусы заказов магазина, работает как абсолютно не связанные вещи. Думаю это надо синхронизировать!