Если задача находится в группе, то:
1. При добавлении файла в задачу или комментарий к задаче в пункте "Найти в Битрикс24" есть пункты "мой диск", "общий диск" и список дисков всех групп. Нужно чтобы диск текущей группы так же был отдельно, чтобы не искать его в общем списке.
2. Было бы неплохо, если бы загруженные напрямую файлы попадали не в скрытый раздел персонального диска, а отдельную папочку в диске проекта, например /<диск_проекта>/приложения_задач/<номер задачи>/