Как разработчик, не вижу оснований для использования библиотеки BX во фронтенде битрикс управление сайтом. Сама по себе библиотека трудна в использовании, а также плохо развита по сравнению с jQuery.
Использование jQuery во фронтенде компонентов - каталога, корзины, оформление заказа поможет разработчикам быстрее и эффективнее править код, а также разработчик получит дополнительную гибкость, BX имеет ограничения по сравнения с jQuery, при работе с измененной структурой DOM например.
Также использование jQuery должно облегчить порог входа для разработчиков системы и уменьшить общее время на разработку. Те использование jQuery является экономически оправданным.
В принципе возможно самому использовать jQuery вместо BX, но любопытный интегратор будет интересоваться что же происходит в BX, будет стараться изучить и понять данную библиотеку хотя по моему опыту на поддержку проекта на BX уходит времени больше если конечно была кастомизация шаблонов (catalog, sale.basket.basket, sale.order.ajax).
Поэтому я за переход платформы (БУС во фронтенде) на jQuery 1.
п.с Как всегда это мое личное мнение. Кто согласен плюсуйте.