можно при создании сайта дополнительные пункты
а лучше отдельный скрипт или подддержка запуска из командной строки для bitrixsetup.php
например php bitrixsetup.php start - и устанавливает редакцию Start
плюсом было бы - если можно было устанавливать так же сторониие модули которые скопированы в папку bitrix/modules/ или local/modules/
после того как завершится установка bitrix